东晋太元八年(383年)，“始兴郡三月大水，平地五丈”。唐显庆四年(659年)七月，连州、连山“山水暴涨，漂没七百余家”。宋端拱元年(988年)，英州自春至夏，雨数月，水坏农田房舍，溺死者甚众。

嘉庆初年阳山县黎洞的洞冠、界滩、大塘一带“洞冠梨”成为贡品献给皇帝。该梨果肉厚、爽口清甜、多汁具香味、色白不变色。十八年 英德、清远2县划地设立佛冈直隶厅(今佛冈县)，直隶广东布政使司。

乾隆元年(1736年)阳山县的鱼水岩、马栏坑、狮子岩等9处开设有煎硝业。是年改广南韶连道为分巡南韶连兵备道，驻韶州，自此至清末，相沿未改。五年阳山县始有商人孔毓倚采煤。七年秋连山县瘟疫流行。

雍正元年(1723年)连州实行“摊丁人亩”，是赋役史上的一次重大改革。七年升连州为直隶州，直隶广东省布政司，与府同级，设知州一员，官秩正四品。直隶州辖连山、阳山2县。改理瑶同知为理瑶军民直隶同知。十一年连州建学院考棚于州城忠报坊，有大小房屋20多间;文场设有可容百余人的应试童生座位。

康熙元年(1662年)平南王尚可喜命重新开凿英德浈阳峡至清远中宿峡道路，全长50公里，架桥63座。工程历一年完成，可通舆马。四年九月清远县实施广东都察院告示:禁下乡征粮，禁空批勒解，禁派夫役等弊政，民皆称颂。连阳游击武君仕遣千总叶琳至瑶排大掌岭平“乱”。

二十四年二月洪秀全与冯云山等人外出传播拜上帝教，到英德、浛洸、阳山、连山等地，并在八排瑶南岗排留下一些手写小册子给当地塾师分发众人，后经寨岗到广西。三十年四五月 拜上帝会部众6000余人，先后在英德县浛洸及清远县滨江、潖江等地活动，袭击官兵。

顺治四年(1647年，南明永历元年)正月清兵攻陷清远县城。七月十六日，明臣都指挥使白常灿(清远县人)，率部收复清城并斩杀知县。九月十九日，清兵再度攻打清城，明守军无一人屈服。清兵进行屠城，杀戮2万余人(一说4万人)，民国版《清远县志》注:2万人为兵，2万人为居民。

洪武元年(1368年)明征南将军廖永忠会同赣州卫指挥使陆仲亨等进取广东，占领英德、连州和清远各地，遂引兵会广州。元守臣何真降，广东平定。是年改广州路为府，清远县属广州府。二年英德州降为英德县，阳山县并入连山县，统属广东行中书省(布政使司)韶州府。三年九月废连山县，复置阳山县，属广州府

至元十五年(1278年)改英德府为英德路，治所称英德总管府，属江西行省广东道。同年程山县复称连山县，并移连州治于连山县，连山成为连州的倚郭县。十七年废连州安抚司，升连州为路，设立总管府(治在连山)，属江西行省。

建炎三年(1129年)清远知县首次编修《清远县志》(已佚)。绍兴二年(1132年)四月都统制岳飞奉诏讨伐曹成，自广西桂岭经连山追至连州。后曹成败走入湘。三年江淮招讨使岳飞在英州等地讨伐盗兵有功，补授英州刺史。六年 连山县降为连山镇。